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2019-05-19
简介3)使用“map-to-pan”策略构建了亚洲栽培稻的泛基因组,获得了268M的日本晴参考序列之外的非冗余序列,预测了1.2万个新的全长基因。在水稻泛基因组中,包含了12770个(53.5%)核心(core)基因家族和9050个(37.9%)分散式(distribute)基因家族。基因或基因家族的存在/缺失变异(PAVs)在主要亚群间也呈现显著差异。同时发现:核心基因比较古老,大多数的新基因表现更年轻和长度偏短;相较于核心基因,分散式基因中存在更多的SNP变异。

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